Dalam menggerakkan roda Organisasi Santri Yafata (OSFATA), pengurus OSFATA memiliki mekanisme kerja hierarkis sebagai berikut:
Bidang-bidang adalah unsur pelaksana yang mempunyai tugas dan fungsi membantu ketua (Rois), dengan menyusun rencana, pelaksanaan, pengendalian, dan mengevaluasi kegiatan masing-masing.